Table ORF and AA Coverage: ratio of matching ORFs and total ORFs, matching AA and total AA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Species ORFs matching ORFs m_ORFs/t_ORFs t_AA m_AA m_AA/tot_AA Domlen ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ old new old new old new old new (new) ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ aaeo 1522 528 527 0.346912 0.346255 482512 117109 116664 0.242707 0.241785 169.078 aful 2409 650 650 0.269822 0.269822 663320 146750 146655 0.221236 0.221092 172.739 bbur 1638 292 289 0.178266 0.176435 432219 66559 65816 0.153994 0.152275 178.363 bsub 4100 1121 1121 0.273415 0.273415 1217000 276684 276596 0.227349 0.227277 189.449 cele 19099 4586 4586 0.240117 0.240117 8096713 1137126 1136801 0.140443 0.140403 145.688 cpne 1052 274 274 0.260456 0.260456 361694 66160 66160 0.182917 0.182917 180.272 ctra 894 259 259 0.289709 0.289709 312553 60778 60295 0.194457 0.192911 173.261 ecol 4290 1192 1191 0.277855 0.277622 1363501 297768 296762 0.218385 0.217647 184.21 hinf 1707 528 528 0.309315 0.309315 520930 126004 125776 0.241883 0.241445 177.149 hpyl 1577 381 381 0.241598 0.241598 500616 89025 89025 0.177831 0.177831 179.848 mgen 479 166 164 0.346555 0.34238 174566 40361 39680 0.231208 0.227307 174.035 mjan 1771 471 470 0.265951 0.265387 501793 93837 93299 0.187003 0.185931 152.201 mpne 677 178 178 0.262925 0.262925 237651 48308 43222 0.203273 0.181872 172.199 mthe 1871 523 522 0.27953 0.278995 526205 144057 105553 0.273766 0.200593 156.375 mtub 3924 1200 1198 0.30581 0.305301 1335687 292155 291496 0.218730 0.218237 183.677 phor 2064 461 461 0.223353 0.223353 568544 97276 97276 0.171097 0.171097 175.272 rpro 837 265 264 0.316607 0.315412 280233 60912 60285 0.217362 0.215125 172.243 scer 6218 1701 1699 0.273561 0.273239 2906890 435006 434481 0.149647 0.149466 185.201 syne 3168 882 882 0.278409 0.278409 1119717 196074 196041 0.175110 0.175081 173.334 tpal 1031 253 252 0.245393 0.244423 350676 59060 58542 0.168418 0.166940 169.197